1
分子生態學
利用DNA、RNA、蛋白質水平上的分子標記技術，研究物種協同進化、生物入侵、物種形成、動植物繁殖等方面的生態與進化問題。
2
生理生態學
研究環境對動物生理功能的影響以及生物體對脅迫等環境適應的生理、生化與分子機制。采用分子、生理、生化與生態學研究方法和理論探討生物脅迫響應的機理。
3
種群生態學
采用宏觀與微觀相結合的手段，對種群數量及其分布開展評估與監測，對其動態及其趨勢進行預測，同時研究親緣地理學，探討珍稀瀕危物種保護以及有害物種防治的相關科學問題。
4
群落與生態系統生態學
研究現有生物多樣性的分布格局、關鍵環境因子對群落中物種組成以及遺傳多樣性的影響，分析生物多樣性與生態系統功能之間的相關性、自然群落生物多樣性的形成與維持與環境變遷的關系，以期揭示生物多樣性的形成與維持機制。
5
景觀生態學與生態工程
研究空間格局、生態過程和功能的相互關系，側重空間異質性、干擾動態、尺度推譯、景觀格局分析等大尺度生態學問題。同時關注生態恢復、生態系統管理、生物多樣性保護等應用性問題。
6
植物多樣性與生態學
研究植物系統發育、物種形成和演化、演替以及植物與環境間相互關系，并從植物親緣地理學等角度揭示植物類群的起源、演化和擴散機制。同時基于特定的植物類群，探討基因和基因家族的進化式樣和規律。
7
水生生物生態學
研究水生態系統中重要類群的遺傳多樣性分布格局、系統發生關系、種群的歷史動態等，以全面深入地理解物種遺傳多樣性的保持機制及其在生物進化過程中發揮的作用。
8
行為生態學
主要研究生態學中的行為機制和動物行為的生態學意義和進化意義。包括覓食行為、筑巢行為、防御行為、領域行為、求偶行為、生殖行為、社會行為、學習行為、通訊行為、時空行為等內容。
9
生物信息學
關注如何有效并且正確地分析高通量測序技術所產生的海量數據，包括相關算法的開發和改進、復雜數據分析流程的平臺建立及其優化、以及特定科學實驗所產生數據的整合分析。
10
進化生物學
研究適用于多個類群的具有普遍性的基本理論、現象和規律，如分子進化、基因組進化、物種間協同進化、入侵生物對新環境所產生的適應性進化及快速進化等。
